고부가가치 야채란 맛과 색, 형태가 우수할 뿐만 아니라 무농약 재배 및 기능성 물질(비타민이나 항산화 물질 등)이 많은 야채를 말한다. 고부가가치 야채를 육성하기 위해서 중요한 것이 바로 육성환경의 제어이다. 일례로 양상추의 최적조건을 들어보면, 일조시간은 16시간이며, 일조가 있을 시에는 기온 25℃ 습도 60~70%, 일조가 없을 시에는 기온 20℃(습도는 동일), CO₂농도는 통상의 2~2.5배인 800~1000ppm(parts permillion)이다. 완전 인공광형의 식물공장은 폐쇄공간이기 때문에 육성환경을 완전히 제어할 수가 있어 출하까지의 기간을 노지재배의 60일에서 최대 25일까지 단축시켜 품질의 균일화에도 기여하고 있다. 또한 외부로부터의 해충과 바이러스가 혼입되지 않아 무농약 재베가 가능하다. 야채의 고부가가치화를 위해 중요한 것은 앞에서 이미 언급한 ‘빛의 제어’이다. 최근의 완전 인공광형 식물공장에서는 LED 광원을 통해, 농작물에 필요한 파장의 빛만을 사용하는 곳도 있다. 이에 따라 <그림 8>과 같이 빛의 환경을 늘 최적의 상태로 제어함으로써 제철 이외의 계절에서도 제철의 것과 변하지 않는 맛과 영양을 지닌 농작물을 육성할 수 있게 되었다. 이와 같이 빛 환경의 제어를 통해 다양한 니즈에 부합한 작물의 육성도 가능하게 되었다. 또한 청색광과 적색광의 영향에서 그 배광配光의 균형을 적절히 조절하여 다양한 색과 형태, 식감 등을 지닌 작물의 육성도 가능해졌다. 게다가 자외선(UV)과 청색과 같은 단파장역의 빛을 쬐이면 항산화 작용 및 생활습관병의 예방효과가 있는 파이토케미컬phytochemical)(식물 유래의 화학물질)이라고 불리는 기능성 물질을 증진시킬 수도 있다. <그림 9, 10>에 파이토케미컬의 일종인 안토시아닌Anthocyanin(폴리페놀Polyphenol<항산화 물질>의 일종)과 클로로겐산Chlorogenicacid (생활습관병 예방효과가 있는 항산화물질)이 UV와 청색광에 의해 증가하고 있는 결과를 나타냈다. <그림 9>는 적색 리프 레터스에 청색광과 적색광을 쬐여 청색광의 비율을 3~28%까지 변화시켰을 시 안토시아닌의 농도 변화를 나타낸 것이다. 그 결과, 청색광의 비율이 3%에서는 약 2㎎/g였던 안토시아닌의 농도가 32%로 약 14㎎/g까지 증가하였고, 그로 인해 적색의 안토시아닌 색소도 증가하였다. <그림 10>에서는 자외선(UV-B)의 강도를 200~1500㎽/㎡까지 변화시켜 키운 모로헤이야Molokheiya(동지중해산의 야채)의 클로로겐산 농도 변화를 나타내었다. 모로헤이야의 클로로겐산 농도 변화는 자외선(UV-B)의 강도가 증가함에 따라 함께 증가하였다. 이처럼 고부가가치의 야채를 안정적으로 육성시키기 위해서는 단파장의 빛을 제어해야 한다. LED 광원을 이용해 광환경 제어가 가능한 완전 인공광형 식물공장은 고부가가치 야채 생산에 최적이라고 할 수 있다. 하지만, 육성환경을 완전히 제어하기 위해서는 ①광원 ②공조 ③펌프 ④제어기기와 같은 설비를 갖춘 건물이 필요하고, 그 때문에 초기투자가 다른 시설농업에 비해 크다. 또 가동 코스트의 비율은 ①:②:기타=3:1:0.1로 코스트의 대부분이 광원에 의한 것이다. 완전 인공광형 식물공장에서 필요한 광량은 1~2만 럭스로 일반조명의 10~50배나 되는 상당히 많은 전기를 필요로 하기 때문에 태양광을 이용하는 다른 시설농업보다 가동 코스트가 많이 발생하는 편이다. 그에 따라 광원에서 발생하는 열을 냉각시키기 위한 공조코스트 역시 가동코스트를 인상시키는 요인이 된다. 그러나 공조기술의 발전에 따라 광원 코스트를 3분의 1까지 낮출 수 있게 되었고, 앞서 언급한 형광등과 마찬가지로 광원의 LED화를 통해 광원에서 발산되는 열량이 감소하여 다단식의 육성방법을 채용할 수 있게 되었다. 또한, 다단식 육성방법의 채용을 통해 공간의 절약화와 더불어 바닥면적당 생산량이 증가하여 종합적인 코스트가 절감되었다.